MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p1

Total Repeats: 28271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_016585	CT	3	6	35777	35782	0 %	50 %	0 %	50 %	374998049
1003	NC_016585	AGCGC	2	10	35789	35798	20 %	0 %	40 %	40 %	374998049
1004	NC_016585	CCA	2	6	35804	35809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374998049
1005	NC_016585	CAG	2	6	35829	35834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374998049
1006	NC_016585	CGGT	2	8	35839	35846	0 %	25 %	50 %	25 %	374998049
1007	NC_016585	GC	3	6	35847	35852	0 %	0 %	50 %	50 %	374998049
1008	NC_016585	GGC	2	6	35853	35858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374998049
1009	NC_016585	CAGGA	2	10	35863	35872	40 %	0 %	40 %	20 %	374998049
1010	NC_016585	GCC	2	6	35893	35898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374998049
1011	NC_016585	CCGG	2	8	35903	35910	0 %	0 %	50 %	50 %	374998049
1012	NC_016585	AGG	2	6	35912	35917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374998049
1013	NC_016585	CAC	2	6	35970	35975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374998049
1014	NC_016585	CAG	2	6	36000	36005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374998049
1015	NC_016585	AGC	2	6	36013	36018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374998049
1016	NC_016585	CGA	2	6	36101	36106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374998049
1017	NC_016585	CAG	3	9	36108	36116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374998049
1018	NC_016585	TGGC	2	8	36142	36149	0 %	25 %	50 %	25 %	374998049
1019	NC_016585	GGC	3	9	36147	36155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374998049
1020	NC_016585	GCC	2	6	36181	36186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374998049
1021	NC_016585	CCG	2	6	36188	36193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374998049
1022	NC_016585	CTG	2	6	36216	36221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374998049
1023	NC_016585	CGCC	2	8	36222	36229	0 %	0 %	25 %	75 %	374998049
1024	NC_016585	GGCG	2	8	36230	36237	0 %	0 %	75 %	25 %	374998049
1025	NC_016585	GTC	2	6	36331	36336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374998049
1026	NC_016585	CCCG	2	8	36338	36345	0 %	0 %	25 %	75 %	374998049
1027	NC_016585	CAG	2	6	36423	36428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374998049
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1030	NC_016585	CCT	3	9	36563	36571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374998049
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1034	NC_016585	GGC	3	9	36770	36778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374998049
1035	NC_016585	GCT	2	6	36809	36814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374998049
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1040	NC_016585	CCG	2	6	36933	36938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374998049
1041	NC_016585	TCG	2	6	36940	36945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374998049
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1046	NC_016585	CCT	3	9	37157	37165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374998049
1047	NC_016585	GC	3	6	37267	37272	0 %	0 %	50 %	50 %	374998049
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1050	NC_016585	GTC	2	6	37368	37373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374998049
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1053	NC_016585	CCGCC	2	10	37526	37535	0 %	0 %	20 %	80 %	374998049
1054	NC_016585	C	6	6	37534	37539	0 %	0 %	0 %	100 %	374998049
1055	NC_016585	AG	3	6	37619	37624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_016585	CAA	2	6	37681	37686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_016585	GGGGC	2	10	37800	37809	0 %	0 %	80 %	20 %	374998050
1058	NC_016585	GCGGTC	2	12	37828	37839	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374998050
1059	NC_016585	CGG	2	6	37887	37892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374998050
1060	NC_016585	CGA	2	6	37893	37898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374998050
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1062	NC_016585	CCGC	2	8	37980	37987	0 %	0 %	25 %	75 %	374998050
1063	NC_016585	GCC	2	6	37993	37998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374998050
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1065	NC_016585	CTC	2	6	38113	38118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374998050
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1072	NC_016585	GCC	2	6	38372	38377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374998050
1073	NC_016585	TCG	2	6	38384	38389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374998050
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1083	NC_016585	GCC	2	6	38554	38559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374998050
1084	NC_016585	CGA	2	6	38565	38570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374998050
1085	NC_016585	TGA	2	6	38583	38588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374998050
1086	NC_016585	ATCAA	2	10	38639	38648	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1087	NC_016585	GAC	2	6	38691	38696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_016585	GCA	2	6	38698	38703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_016585	TCC	2	6	38734	38739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_016585	CTC	2	6	38745	38750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_016585	TGC	2	6	38762	38767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374998051
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1093	NC_016585	CGG	2	6	38852	38857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374998051
1094	NC_016585	GATC	2	8	38867	38874	25 %	25 %	25 %	25 %	374998051
1095	NC_016585	TGG	2	6	38909	38914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374998051
1096	NC_016585	TCC	2	6	38917	38922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374998051
1097	NC_016585	TCGCCT	2	12	38993	39004	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	374998051
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1099	NC_016585	TGG	2	6	39047	39052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374998051
1100	NC_016585	CAT	2	6	39084	39089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374998051
1101	NC_016585	TGG	2	6	39092	39097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374998051
1102	NC_016585	GCCG	2	8	39108	39115	0 %	0 %	50 %	50 %	374998051
1103	NC_016585	CGG	2	6	39118	39123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374998051
1104	NC_016585	G	6	6	39122	39127	0 %	0 %	100 %	0 %	374998051
1105	NC_016585	CGG	2	6	39128	39133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374998051
1106	NC_016585	GGCT	2	8	39136	39143	0 %	25 %	50 %	25 %	374998051
1107	NC_016585	GGC	2	6	39147	39152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374998051
1108	NC_016585	GCA	2	6	39187	39192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374998051
1109	NC_016585	TGGC	2	8	39193	39200	0 %	25 %	50 %	25 %	374998051
1110	NC_016585	GCC	2	6	39220	39225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374998051
1111	NC_016585	GCT	2	6	39249	39254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374998051
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1113	NC_016585	GCT	2	6	39261	39266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374998051
1114	NC_016585	GC	3	6	39288	39293	0 %	0 %	50 %	50 %	374998051
1115	NC_016585	CGG	2	6	39306	39311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374998051
1116	NC_016585	GC	3	6	39314	39319	0 %	0 %	50 %	50 %	374998051
1117	NC_016585	GGC	2	6	39320	39325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374998051
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1121	NC_016585	CCG	2	6	39374	39379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374998051
1122	NC_016585	ACC	2	6	39385	39390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374998051
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1125	NC_016585	CCAT	2	8	39497	39504	25 %	25 %	0 %	50 %	374998051
1126	NC_016585	GTC	2	6	39519	39524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374998051
1127	NC_016585	GCT	2	6	39525	39530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374998051
1128	NC_016585	GGGC	2	8	39535	39542	0 %	0 %	75 %	25 %	374998051
1129	NC_016585	CGG	2	6	39559	39564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374998051
1130	NC_016585	TGG	2	6	39572	39577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374998051
1131	NC_016585	CTG	2	6	39586	39591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374998051
1132	NC_016585	GCC	2	6	39595	39600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374998051
1133	NC_016585	TGGA	2	8	39619	39626	25 %	25 %	50 %	0 %	374998051
1134	NC_016585	GCC	2	6	39658	39663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374998051
1135	NC_016585	GCG	2	6	39745	39750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374998051
1136	NC_016585	GCGCC	2	10	39788	39797	0 %	0 %	40 %	60 %	374998051
1137	NC_016585	CGGT	2	8	39803	39810	0 %	25 %	50 %	25 %	374998051
1138	NC_016585	GGC	2	6	39829	39834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374998051
1139	NC_016585	CTGGGG	2	12	39861	39872	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	374998051
1140	NC_016585	TCGGCG	2	12	39884	39895	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374998051
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1152	NC_016585	GGC	2	6	40310	40315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374998052
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1154	NC_016585	GAT	2	6	40328	40333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374998052
1155	NC_016585	GCC	2	6	40380	40385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374998052
1156	NC_016585	TCCG	2	8	40393	40400	0 %	25 %	25 %	50 %	374998052
1157	NC_016585	TGC	2	6	40408	40413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374998052
1158	NC_016585	CGG	2	6	40414	40419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374998052
1159	NC_016585	GCTG	2	8	40438	40445	0 %	25 %	50 %	25 %	374998052
1160	NC_016585	G	6	6	40543	40548	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1161	NC_016585	GCCC	2	8	40659	40666	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1162	NC_016585	TGT	2	6	40715	40720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374998053
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1164	NC_016585	GTC	2	6	40762	40767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374998053
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1168	NC_016585	TGCGC	2	10	40974	40983	0 %	20 %	40 %	40 %	374998053
1169	NC_016585	GGCC	2	8	40990	40997	0 %	0 %	50 %	50 %	374998053
1170	NC_016585	CGG	2	6	41001	41006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374998053
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1185	NC_016585	CGA	2	6	41514	41519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374998053
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1190	NC_016585	ATGCGG	2	12	41675	41686	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374998053
1191	NC_016585	GAT	2	6	41725	41730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374998053
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1194	NC_016585	ACCGGC	2	12	41860	41871	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374998053
1195	NC_016585	CGG	2	6	41883	41888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374998053
1196	NC_016585	CAG	2	6	41899	41904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374998053
1197	NC_016585	GAC	2	6	41932	41937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1198	NC_016585	CATGTC	2	12	42022	42033	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1199	NC_016585	TG	3	6	42061	42066	0 %	50 %	50 %	0 %	374998054
1200	NC_016585	CG	3	6	42069	42074	0 %	0 %	50 %	50 %	374998054
1201	NC_016585	G	6	6	42079	42084	0 %	0 %	100 %	0 %	374998054
1202	NC_016585	CTC	2	6	42128	42133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374998054
1203	NC_016585	CGG	2	6	42149	42154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374998054
1204	NC_016585	CAC	2	6	42185	42190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374998054
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1206	NC_016585	GGT	2	6	42301	42306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374998054
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1209	NC_016585	GC	3	6	42439	42444	0 %	0 %	50 %	50 %	374998054
1210	NC_016585	CCT	2	6	42454	42459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374998054
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1213	NC_016585	CGA	2	6	42523	42528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374998054
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1215	NC_016585	TGC	2	6	42555	42560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374998054
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1218	NC_016585	CCGG	2	8	42632	42639	0 %	0 %	50 %	50 %	374998054
1219	NC_016585	GCT	2	6	42646	42651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374998054
1220	NC_016585	CAG	2	6	42704	42709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374998054
1221	NC_016585	CCGG	2	8	42724	42731	0 %	0 %	50 %	50 %	374998054
1222	NC_016585	GCC	2	6	42764	42769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374998054
1223	NC_016585	ACGC	2	8	42807	42814	25 %	0 %	25 %	50 %	374998055
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1231	NC_016585	GCGG	2	8	42994	43001	0 %	0 %	75 %	25 %	374998055
1232	NC_016585	CAC	2	6	43009	43014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374998055
1233	NC_016585	CGA	2	6	43020	43025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374998055
1234	NC_016585	TCA	2	6	43062	43067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374998055
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1236	NC_016585	TCG	2	6	43133	43138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374998055
1237	NC_016585	CGAAGG	2	12	43140	43151	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	374998055
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1239	NC_016585	GCAG	2	8	43173	43180	25 %	0 %	50 %	25 %	374998055
1240	NC_016585	CCA	2	6	43182	43187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374998055
1241	NC_016585	CGC	2	6	43191	43196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374998055
1242	NC_016585	CAC	2	6	43198	43203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374998055
1243	NC_016585	GC	4	8	43231	43238	0 %	0 %	50 %	50 %	374998055
1244	NC_016585	AGC	2	6	43253	43258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374998055
1245	NC_016585	CG	3	6	43272	43277	0 %	0 %	50 %	50 %	374998055
1246	NC_016585	CTG	2	6	43279	43284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374998055
1247	NC_016585	CGT	2	6	43297	43302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374998055
1248	NC_016585	GGC	2	6	43318	43323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374998055
1249	NC_016585	GGC	2	6	43339	43344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374998055
1250	NC_016585	GCC	2	6	43372	43377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374998055
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1489	NC_016585	GCCG	2	8	52108	52115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1493	NC_016585	CCCTC	2	10	52283	52292	0 %	20 %	0 %	80 %	374998060
1494	NC_016585	GGC	2	6	52329	52334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374998060
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1496	NC_016585	GCA	3	9	52424	52432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374998060
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1499	NC_016585	GCC	2	6	52498	52503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374998060
1500	NC_016585	GC	3	6	52506	52511	0 %	0 %	50 %	50 %	374998060

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